Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SmgcF6VRN1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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