Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm28305F6U473 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms