Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Syngap1F6SEU4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms