Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Urb2E9Q7L1 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Urb2E9Q7L1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms