Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3250E9Q1M3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms