Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syde2E9PUP1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syde2E9PUP1 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms