Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb3D3Z6J4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms