Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ccdc6D3YZP9 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc6D3YZP9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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