Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms