Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usf3B2RUQ2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms