Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CtcflA2APF3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms