Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms