Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Frmpd4A2AFR3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms