Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

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Length 1,818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Itgb4A2A863 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Itgb4A2A863 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Itgb4A2A863 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Itgb4A2A863 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Itgb4A2A863 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Itgb4A2A863 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Itgb4A2A863 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Itgb4A2A863 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Itgb4A2A863 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Itgb4A2A863 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Itgb4A2A863 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb4A2A863 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms