Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc194A0A140LIT1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc194A0A140LIT1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc194A0A140LIT1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc194A0A140LIT1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc194A0A140LIT1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc194A0A140LIT1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ccdc194A0A140LIT1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc194A0A140LIT1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc194A0A140LIT1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc194A0A140LIT1 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc194A0A140LIT1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ccdc194A0A140LIT1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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