Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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