Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm3550W4VSN7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms