Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Top3bQ9Z321 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms