Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Knop1Q9Z2Q2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Knop1Q9Z2Q2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms