Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn7Q9Z261 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms