Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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