Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms