Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
VarsQ9Z1Q9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
VarsQ9Z1Q9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms