Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clip2Q9Z0H8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms