Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stxbp4Q9WV89 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms