Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nme3Q9WV85 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms