Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psmb3Q9R1P1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms