Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nek3Q9R0A5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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