Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms