Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rnf4Q9QZS2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Rnf4Q9QZS2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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