Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ripk3Q9QZL0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms