Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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