Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc5Q9QX29 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms