Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sfmbt1Q9JMD1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sfmbt1Q9JMD1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sfmbt1Q9JMD1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sfmbt1Q9JMD1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sfmbt1Q9JMD1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sfmbt1Q9JMD1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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