Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Rabgef1Q9JM13 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Rabgef1Q9JM13 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Rabgef1Q9JM13 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Rabgef1Q9JM13 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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Rabgef1Q9JM13 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Rabgef1Q9JM13 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rabgef1Q9JM13 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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