Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pkd2l2Q9JLG4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pkd2l2Q9JLG4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms