Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Scamp5Q9JKD3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms