Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim54Q9ERP3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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