Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tfcp2Q9ERA0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tfcp2Q9ERA0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tfcp2Q9ERA0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tfcp2Q9ERA0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms