Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgshQ9EQ08 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms