Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Syde1Q9DBZ9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Syde1Q9DBZ9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms