Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc89Q9DA73 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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