Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp12Q9D9M2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp12Q9D9M2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms