Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Srp19Q9D7A6 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Srp19Q9D7A6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Srp19Q9D7A6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Srp19Q9D7A6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Srp19Q9D7A6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Srp19Q9D7A6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Srp19Q9D7A6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Srp19Q9D7A6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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