Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Syce1Q9D495 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Syce1Q9D495 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Syce1Q9D495 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Syce1Q9D495 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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