Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rufy3Q9D394 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rufy3Q9D394 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms