Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim42Q9D2H5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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