Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmbr1lQ9D1E5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms