Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2cQ9D1C1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms