Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Mrpl28Q9D1B9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Mrpl28Q9D1B9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Mrpl28Q9D1B9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Mrpl28Q9D1B9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Mrpl28Q9D1B9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Mrpl28Q9D1B9 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Mrpl28Q9D1B9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Mrpl28Q9D1B9 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Mrpl28Q9D1B9 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Mrpl28Q9D1B9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Mrpl28Q9D1B9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Mrpl28Q9D1B9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Mrpl28Q9D1B9 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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Mrpl28Q9D1B9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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